Nel tipico stile Škoda, il bagagliaio della Superb Wagon offre caratteristiche estremamente pratiche. Gli oggetti possono essere fissati nel bagagliaio utilizzando le chiusure cargo. Basta far scorrere, ad esempio, le scatole o le borse della spesa tra le chiusure e queste non scivoleranno più. Gli elementi di fissaggio del carico possono essere ripiegati e riposti a lato del bagagliaio o sotto il pianale variabile.