Il comfort interno di Škoda Karoq S-Tech è incredibile, grazie al sistema VarioFlex con il quale i sedili posteriori esterni sono scorrevoli e si può creare o più spazio per i passeggeri oppure per il bagagliaio da 479-588 litri. Inoltre, permette di abbassare, ribaltare oppure rimuovere ogni singolo sedile per una capacità volume di carico massimo di 1.810 litri.

Il Climatizzatore bi-zona garantisce una temperatura interna ottimale. Il conducente e il passeggero anteriore all'interno di Škoda Karoq S-Tech possono controllare la temperatura nella loro zona autonomamente.

ŠKODA KAROQ S-TECH è dotato di serie di sensori di parcheggio posteriori per agevolare le manovre di parcheggio. In fase di manovra, previene l'impatto con gli ostacoli che si trovano nelle vicinanze (per una velocità massima di 10 km/h). Se viene rilevato un ostacolo, in base alla distanza dall'ostacolo stesso e alla velocità della vettura, il sistema avvia la frenata di emergenza.